协会于2003年10月10日正式成立，为依照国家有关法律法规自愿组成的自律性、非营利性的社会团体。会员分布于制药工业、生物医药、药品辅料、药品包装材料、中药加工、药品批发零售、制药机械、科研院所等领域，覆盖了安徽省医药行业主要的大中型工商企业。协会由安徽省经济和信息化委员会主管，接受安徽省经济和与信息化委员会与安徽省食品药品监督管理局的业务指导。宗旨是“服务”。协会致力于推动全省医药行业的技术进步和管理现代化，推动医药体制改革，反映行业企业的愿望和要求，维护会员单位的合法权益，维护公平竞争与市场秩序，促进医药行业的改革和发展。